Quarz ist oft mit anderen Mineralien vergesellschaftet. Für den Bergmann war früher in den Erzlagerstätten nur das Erz abbauwürdig, während die Gangart mit Quarz oder Calcit eher von geringem Interesse war. Seit dem das Mineraliensammeln an Bedeutung gewonnen hat, richtet sich die Aufmerksamkeit nicht nur auf die Erzmittel, sondern auch auf schöne Ausprägungen und Kombinationen der anderen Minerale. Einschlüsse von Fremdmineralien in Quarz werden bei den Einschlüssen behandelt. Auf Bild 1 ist eine typische Paragenese aus Dalnegorsk in Russland zu sehen. Milchquarz ist mit Bleiglanz und Zinkblende vergesellschaftet. Bei der Stufe aus Itremo in Madagaskar (Bild 2) sind die Quarzkristalle von dem Eisenerz Goethit überkrustet. Bild 3 (aus Peru) zeigt eine wunderschöne Paragenese von Pyrit mit Bergkristall. Quarzdrusen sind oft mit anderen Mineralien besetzt, zum Beispiel die Drusen aus Chihuahua in Mexiko (Bild 8, mit Calcit) oder die Amethyst-Drusen aus Iraí in Brasilien (Bild 9, mit einem Aggregat aus rhomboedrischem Calcit). Die Quarz-Drusen aus der Gegend um Idar Oberstein enthalten als zweite Mineraliengeneration oft ein anderes Mineral. Besonders häufig sitzen in den Drusen aus dem Steinbruch Juchem Calcite (Bilder 4 bis 6), etwas seltener andere Mineralien wie Chabasit (Bild 7, Rauchquarz-Geode aus Freisen).

Die alpinen Bergkristalle kommen oft zusammen mit anderen Mineralien vor, zum Beispiel mit Calcit. Auf Bild 10 ist ein gelb gefärbter Bergkristall zusammen mit weißem, skalenoedrischem Calcit zu sehen. Bild 11 zeigt eine perfekte Kombination von klarem Bergkristall mit einem Calcitkristall. Beide Stufen wurden am Piz Beverin gefunden. Von der Alp Nova aus Graubünden stammen rhomboedrische Calcite, die mit Bergkristall vergesellschaftet sind (Bild 12). Einmalig schöne Paragenesen kennt man aus China. Bild 13 stellt eine Rauchquarzstufe mit rotem Spessartin-Granat auf weißem Dolomit aus der Xungxiao Mine dar. Bei der Stufe auf Bild 14 aus Jinkouhe in China sitzen tafelige Baryt-Kristalle auf Bergkristall. Gelegentlich kommt es beim Quarz auch vor, dass er von einem anderen Mineral ersetzt wird. Bei dem Bergkristall aus Corinto in Brasilien (Bild 15) sind die Spitzen durch eine Pseudomorphose zu dem Feldspat Orthoklas geworden. Auf dem rechten Kristall sitzt sogar noch eine zweite Generation Orthoklas.